En 1997, Raphaël Helle rejoint l'agence de photographes de presse Editing et se confronte à des sujets sociopolitiques comme le Front National à Vitrolles. Par la suite, il est le premier photographe à suivre José Bové, à Seattle, Davos, Gênes... En 2000, il s'installe en Savoie et travaille pour la presse nationale. Entre 2003 et 2005, il publie plusieurs livres dont «Lyon 8 décembre, la fête des lumières », une commande de la ville de Lyon pour la quinzième édition de cette manifestation, «Les pionniers de l'or blanc », aux éditions Glénat et «Aurillac aux limites », ouvrage collectif aux éditions Actes-Sud à l'occasion des vingt ans du Festival international de théâtre de rue d'Aurillac.

Depuis deux ans il mène un travail photographique sur les diverses alternatives proposées dans la lutte contre les gaz à effet de serre.